生物样本库信息管理系统

生物样本库信息管理系统

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信息管理系统是样本库质量管理体系建立过程的重要环节,借助计算机将信息技术引入到生物样本库质量管理体系中。ISO 20387 标准的发布,生物样本库面临新挑战——需要开发一个专为生物样本库而设计的质量管理体系。根据该标准对质量管理的要求,它是以生物样本为核心,储存和管理样本标准化采集、运输、处理、保存和分发过程
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产品介绍


信息管理系统是样本库质量管理体系建立过程的重要环节,借助计算机将信息技术引入到生物样本库质量管理体系中。

ISO 20387 标准的发布,生物样本库面临新挑战——需要开发一个专为生物样本库而设计的质量管理体系。

根据该标准对质量管理的要求,它是以生物样本为核心,储存和管理样本标准化采集、运输、处理、保存和分发过程中的相关信息,

以及与样本关联的临床数据,并为样本管理者和使用者提供信息查询、分析、存储和挖掘。该系统涵盖资源要求、过程要求和质量管理体系要求的功能,

共设计 8 个功能模块:样本入库管理模块、样本分发管理模块、样本质控管理模块、知情伦理管理模块、仪器设备管理模块、试剂耗材控制管理模块、

人员办公管理模块、统计报告模块。

结合生物样本库建设的现状,上海远诚科技经过三年多时间的努力,成功地打造了一套较为成熟、可供样本库行业参考和推广的个性化定制的生物样本库信息管

理系统,使得样本库信息管理的整体流程更加规范化和智能化,保障了样本质量,并通过中国合格评定国家认可委员会的现场评审专家的认可。

本文主要介绍我司基于ISO 20387 标准的生物样本库信息管理系统的建设及应用。


1、 ISO 20387 标准的内容

ISO 20387 提出了生物样本保藏机构应遵守的要求,主要包含五个方面:通用要求、结构要求、资源要求、过程要求和管理要求,标准对每一项内容进行了详尽的规定。

在资源要求上,规定了人员,设备,基础设施,专用场地和环境要求,外部提供的过程、产品和服务等要素的要求。过程要求包括生物样本的采集、接收、分发、运输,可追溯性,质量控制,制备和储存,信息和数据管理,不符合输出,报告要求等。管理要求包括质量管理体系文件记录和控制、风险防范措施、纠正措施、持续改进、内部审核、质量管理评审。

2、 体系文件建立

建立包括《样本库信息管理系统工作人员操作规程》《样本库信息管理系统医护人员操作规程》《库存样本核查操作规程》等作业指导书,保证样本库信息管理系统的操作能够得到正确的使用;建立《样本及其数据可追溯性程序》《样本质量报告控制程序》等,以确保信息系统在设计、开发、规范化、风险评估等方面能够得到有效地控制;建立《信息和数据管理程序》以确保系统的安全性和保证各个用户角色在程序规定的授权范围内使用信息系统。

3 、建设范围

该系统是基于 B/S 架构即浏览器和服务器架构模式,以流程为核心的高度自定义管理平台,可以满足生物样本库工作人员和临床医护人员同时查看库内样本的需求。该系统可以在医院内部网络任一台电脑登录使用,方便临床医护人员随时下达留样医嘱,医嘱下达后,护士采样、标本运送、标本接收等环节都能在系统实现记录,保证各个环节的有效控制,且该系统与检验信息系统、病房医院信息系统对接,通过该系统可以直接查询捐献者的电子病历信息,为达成样本采集、处理及存储的标准化、临床诊疗规范化、样本质量控制及分析奠定坚实基础。针对目前全国医院病历数据、生物样本缺乏共享而造成的巨大资源浪费等严重问题,以期通过该系统建立一套可行的、标准的、规范的、可供样本库行业借鉴和推行的信息系统与运作模式。另一方面,该系统还增加了试剂耗材出入库管理、人员和办公管理、仪器设备管理等功能,保障了生物样本库日常运作。

3.1、 基础设施

基础设施主要有机房服务器、用户终端、条码扫码枪、打印色带、标签打印机、低温条码标签、高拍仪、样本库信息管理系统和 Windows 操作系统等。

3.2 、应用情况

3.2.1 主体流程 结合现有样本库体系,为实现课题项目申请、样本出入库、数据采集、报告生成、数据统计、试剂耗材管理以及流程审批等过程的无纸化

流程中的各个环节均可由计算机记录。

3.2.2 在样本入库使用前,需要信息管理员或系统开发技术人员设置好捐献者的信息格式、存储设备规格、标本和样本信息格式以及操作用户字典等信息。

样本库工作人员扫描条码接收标本后,对标本进行初步判断和质量评估,如标本不符合入库标准,可退回临床并进行重新采样。

设置相应的标本分装模板,在标本分装完毕之后,自动创建对应的样本管数及信息,随后将样本管入库到存储设备冻存盒上的唯一位置,

打印二维码标签,将标签贴于存放样本的冻存管外壁,如使用预置二维码冻存管,可把二维码标签信息批量扫码一一匹配录入系统,

最后将实体样本根据入库的位置信息对应地依次快速放入实体库

入库样本的处理方法或存储条件等基本信息可通过样本信息操作界面进行修改,系统能够自动记录操作者编辑过程的痕迹,以便溯源。

3.2.3 样本是宝贵的资源,不能随意分发,系统中设立一套完整的样本分发审核流程。研究人员使用样本前需要先提出样本使用申请;

样本库人员进行初步审核,再由样本库负责人确认;确认通过后方可在指定日期进行样本分发。要完成上述的流程操作,

样本分发模块中具备样本申请、样本筛选、样本申请审核、样本出库单打印、样本确认分发功能:

样本分发申请:申请单需记录样本使用申请人的基本信息(如:姓名、工号、所属单位部门、联系电话等),申请使用信息(如:研究方向、样本用途、样本去向、预约取样日期等),申请分发的样本信息(如:样本类型、数量、样本编号等)。

样本筛选:申请人可根据研究需求(如:样本类型、捐献者编号、样本容量、数量等)进行样本筛选。

样本申请审核:样本管理者可根据具体情况通过或者驳回样本申请。

样本出库单打印:样本线下分发时应该有一份具体的样本信息对照表,防止分发过程中出现少分、多分或者错分的状况。

样本确认分发:样本完成分发后应在系统上确认信息(如:分发操作者、分发日期、样本状态)。

3.2.4 系统支持对已入库的样本进行质量检测,可根据需求随机生成质控清单,并进行线下出库质检,质检完成后可在线上记录质检信息并对质检样本进行评分。用户可自由定义分数的合理区间,系统将其分为分数在合理区间内的分数在阈值附近的分数在合理区间外的的样本,做相应标记。

具体功能有:

生成质控清单:根据选择条件(样本类型、设备、数量)随机抽取质控样本并加入清单;

查看所有清单:列出所有质控清单,包括已质检的和未质检的。删除质控清单:删除不需要的未质检状态的质控清单;

打印质检清单:打印样本质控清单添加质控信息,为检测的冻存样本补全样本质控数据(如核酸检测数据、PBMC 检测数据等);

完成质控:确认质控操作已完成。

3.2.5 知情伦理管理模块

3.2.5.1 捐献者及知情同意书管理 捐献者信息可从医院系统中抓取,包括但不限于 HISLIS、手术、病理信息等数据。

具体功能有:

查看:根据不同角色列出对应权限的捐献者信息;

编辑:编辑捐献者的信息;

上传:连接高拍仪通过拍照形式为选择的捐献者上传知情同意书文件;

提醒:列出未上传知情同意书的患者列表并提醒各科室或团队用户及时上传。

3.2.5.2 课题及伦理批件管理 课题信息系统支持课题信息的记录,记录内容包括课题名称、等级、负责人、成员、所属科室、团队等,并支持课题样本统计,

以及伦理批件的上传及有效期过期提醒。具体功能有:

创建课题:添加课题项目信息;

编辑课题:修改课题项目信息;

删除课题:删除无效的课题或未收样课题信息;

添加伦理批件:为选择的课题添加伦理批件,并设置有效期过期提醒。

3.2.6 试剂耗材管理模块

3.2.6.1 生物样本库需管理各种各样的试剂耗材,使用信息系统管理试剂耗材出入库,能够确保生物样本库的日常正常运行。

利用信息技术,通过扫描条码入库,提高试剂耗材入库效率,提高准确度。我科在设计这一功能时以物品商品码作为入库凭证码,

以最小包装作为数量单位。通过扫描商品码信息获取已预置的物品名称、规格型号、厂家等信息。

输入物品批号、有效期、入库日期后打印入库条码并粘贴于物品外包装上。

所有物品的入库条码均为唯一识别码,以确保每一入库的试剂耗材的唯一性和可溯源性。

当物品需要出库时,扫描物品入库时粘贴的条码,如需多份物品同时出库时,扫描多个条码信息。此时,物品进入待出库状态,

需要试剂耗材管理员进行最后出库确认。当库存达到一定上限或者下限时,系统提示样本库人员是否应该采买,以保证样本库日常运作顺利。

3.2.6.2 供应商管理 

档案管理:字段设置供应商基本信息(供应商名称、供应商联系人、联系电话、微信号、公司地址、备注),供应商资质材料(可上传附件),可提供试剂耗材产品清单;

评估管理:字段设置评估意见、评估人、审核人、日期,评估记录主要用于供应商资质评定。

3.2.7 仪器设备管理模块 仪器设备管理是保证生物样本质量的重要部分。开发仪器设备管理系统,应将设备的序列号、型号、价格、生产日期、生产商家等基本信息,以及每个设备的存放地点、负责人、使用情况等都录入系统。设计了仪器设备管理功能模块,不仅满足了资质认定、认可的要求,而且给仪器设备的使用、维修和日常维护工作带来了诸多的方便。具体功能有:

添加仪器设备的记录;

添加仪器设备维护使用记录;

添加仪器设备校准记录;

查看仪器设备维护记录。

3.2.8 人员和办公管理, 系统能将标准化质量管理体系文件及科室管理等文件录入系统电子化,支持 DOCPDF 等常用文件格式。在平台上实现工作人员的办公信息化管理,包括上岗资质、培训、考勤报表管理、节假日排班、通知发布、学术交流活动、文献共享等。

3.2.9 统计报告模块 ,系统具备统计模块,可对各团队的样本出入库数量、每日工作量统计、月度工作量统计,年度工作量统计,能实现各院区工作量的实时统计,方便领导层合理分配工作,为人员调动提供可供参考数据。可统计内容包括但不限于各样本类型样本统计、样本出入库统计、疾病样本统计、科室样本统计、团队样本统计、废弃样本统计、存储设备使用率统计等,并且支持多种格式导出(FDFPNGEXCEL 等),报告内容包括样本质量报告、盘库单、质控记录单、样本使用记录单等,报告内容可自定义,以样本质量报告为例:应包含标题、地址、日期、样本唯一编号、生物样本及相关数据的质量信息、储存条件等。